马达加斯加地形独特，各地气候差异较大。东部属于热带雨林气候，终年湿热，年降水量达2000-3800毫米，年平均气温约24℃中部高原属于热带高原气候，气候温和，年降水量为1000-2000毫米，年平均气温约18℃西部处在背风一侧，降水较少，属于热带草原气候，年降水量为600-1000毫米，年平均气温约26.6℃南部地区属于半干旱气候，年降水量低于600毫米，年平均气温约25.4℃。受季风的影响，全岛4-10月为旱季，11月-次年3月为雨季。首都塔那那利佛海拔约1，200米，年平均气温18°C。